Es handelt sich vermutlich um ein Timeout. Da ist nicht relevant, wo CPU verbraucht wird sondern wo ein Thread auf etwas wartet, ohne etwas zu tun.
Daher:
1) Stelle die Situation nach, in der es zu der 1-minuetigen Wartezeit kommt.
2) Wie hoch ist die CPU-Auslastung in dieser Zeit?
3) Kopiere am besten mal alle Stack-Traces aller Threads in eine Text-Datei
Punkt 3 ist in der Java Console schwierig, weil sich die Tabelle ja dauernd aktualisiert. Alternativ koenntest du auch die PID von Jameica im Taskmanager ermitteln und dann mit "jstack $PID" den Thread-Dump erzeugen. Das geht auch unter Windows.
Siehe
http://middlewaremagic.com/weblogic/?p=2281